Отделы безопасности были образованы приказом Министерства внутренних дел Российской Федерации от 15 декабря 1992 года. Этим приказом функции охраны и надзора за осуждёнными были переданы от внутренних войск органам исполняющим наказание. При этом, на базе оперативно-режимных отделов были созданы отделы безопасности. Тогда же в структуре отделов безопасности появились дежурная служба и группа надзора. Передача функций надзора органам, исполняющим наказание, значительно повысила эффективность процесса исполнения уголовных наказаний в виде лишения свободы.
В подразделениях безопасности выполняются ключевые задачи, стоящие перед уголовно-исполнительной системой страны – обеспечение безопасности осужденных и сотрудников исправительных учреждений, предотвращение передачи лицам, отбывающим наказание запрещенных предметов и веществ, их изъятие, организация работы комнат краткосрочных и длительных свиданий.
Сотрудники этих отделов находятся на самых передовых рубежах, выполняя важнейшую функцию, возложенную на пенитенциарную систему по соблюдению установленного порядка исполнения и отбывания наказаний в исправительных учреждениях.